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Les livrables logiciels sont :
Avant d'installer la bibliothèque MED-fichier, il faut disposer d'un accès à une version compilée de la bibliothèque HDF V5. Pour MED-fichier V2.3, il s'agit de HDF V5-1.6.5 (version recommandée).
MED-fichier V2.3 a été développée et validée sous :
PCs LINUX 32/64 BULL Novascale 4040 Linux 64 SUN-SOLARIS BLUEGENE
Pour désarchiver le fichier contenant les sources taper :
gunzip med-2.3.6.tar.gz tar xvf med-2.3.6.tar
Vous trouverez dans le répertoire obtenu, l'ensemble des livrables. La procédure d'installation permet de compiler et installer :
Avant de lancer l'installation, la variable d'environement HDF5HOME doit être positionnée à l'emplacement d'HDF5 sinon vous pouvez utiliser l'option --with-hdf5=<hdf5 path> à l'étape de configuration. Si aucune option n'est utilisée, med cherche hdf dans /usr.
export HDF5HOME=/local/tools/hdf5-1.6.5
Il faut ensuite se placer dans le répertoire où se trouvent les livrables et lancer l'installation en tapant les commandes :
./configure --prefix=/local/tools/med2.3.6 make make check make installVous pouvez également consulter le fichier README pour des informations complémentaires.
Dans la commande "configure", le paramètre "--prefix" permet d'indiquer où installer la bibliothèque. Si l'installation s'effectue correctement, vous trouverez dans le répertoire cible l'arborescence suivante :
local | ---tools | ---med2.3.6 | --- bin | --- include | --- libDescription :
La commande "make check" permet de lancer et valider les tests.
Pour plus de détails et en particulier pour paramétrer les options de compilation, vous pouvez consultez le fichier README.
Il reste à mettre à jour les variables d'environnement :
pour l'accès aux librairies dynamiques HDF et MED. Sur un système gérant les dépendances entre bibliothèques, le positionement de cette variable ne devrait pas être necessaire.
export LD_LIBRARY_PATH=/local/tools/hdf5-1.6.5/lib:/local/tools/med2.3.6/lib:${LD_LIBRARY_PATH} export PATH=/local/tools/2.3.6/bin:${PATH}
L'utilisation de la bibliothèque à l'édition de lien se fait de manière classique. Voici un exemple simple d'un makefile sous LINUX :
HDFHOME = /local/tools/hdf5-1.6.5 HDFINCLUDE = ${HDFHOME}/include HDFLIB = ${HDFHOME}/lib MEDHOME = /local/tools/med2.3.6 MEDINCLUDE = ${MEDHOME}/include MEDLIB = ${MEDHOME}/lib CC = gcc CFLAGS = -DPCLINUX -I${HDFINCLUDE} -I${MEDINCLUDE} -I./ LFLAGS = -L${HDFLIB} -L${MEDLIB} -lmed -lhdf5 -lm -lz all : main.out main.out : main.c ${CC} main.c ${CFLAGS} ${LFLAGS} -o main.out clean : rm *.out *.o
Remarque : la bibliothèque MED utilise le C++ depuis sa version 2.3.6. Dans le cas d'une édition des liens d'un programme fortran avec la bibliothèque MED statique, il est necessaire de préciser le nom et le chemin d'accès à la bibliothèque C++
exemple : LFLAGS = -L${HDFLIB} -L${MEDLIB} -lmed -lhdf5 -lm -lz -L/usr/lib/gcc-lib/i486-linux/3.3.5/ -lstdc++